Das Examen für Kirchenmusik A erfolgte dann an der Berliner Universität der Künste (UdK). Hier erhielt er wertvolle Anregungen vor allem durch Prof. Uwe Gronostay (Chorleitung) sowie Prof. Leo van Doeselaar (Orgel), bei dem er später auch noch das Konzertexamen ablegte.

Unter der künstlerischen Anleitung von Frau Prof. Mitzi Meyerson beschloss er seine Studien mit dem Solistendiplom im Fach Cembalo und historische Tasteninstrumente.

Heiko Holtmeier konzertiert seit mehreren Jahren im In- und Ausland als Organist, Cembalist und Pianist. Neben solistischen Aufgaben nimmt dabei die Kammermusik und das Spiel mit Orchester einen wichtigen Platz ein. So konzertierte er mehrfach als Solist im Berliner Konzerthaus und in der Philharmonie mit bedeutenden Dirigenten wie Sir Georg Solti und Jörg-Peter Weigle.

Er bekleidet das Amt des Kirchenmusikers an der Dominikanerkloster-Kirche St. Paulus in Berlin-Moabit. Schon in seiner Jugend erhielt er mehrere Preise in Wettbewerben, darunter erste Preise auf Bundesebene im Wettbewerb Jugend musiziert, einen ersten Preis beim Klavierwettbewerb Grotrian-Steinweg in Braunschweig sowie den Emsländischen Kulturpreis.

Mehrere CD-Einspielungen in den letzten Jahren runden sein künstlerisches Profil ab. Eine Einspielung mit Klaviermusik der Geschwister Mendelssohn wurde 2009 vom Berliner Tagesspiegel als eine der besten Aufnahmen des Jahres deklariert.

Im Herbst 2010 wurden zwei Orgel-CD-Einspielungen beim Label JUBALmusic möglich. Zum einen Musik aus der Barockzeit sowie der deutschen und französischen Romantik und Spätromantik, eingespielt auf der 3-manualigen Oberlinger-Orgel (1975) in St. Paulus, zum anderen Orgelmusik aus Barock und Spätromantik zum 75-jährigen Jubiläum der Walcker-Orgel (4 Manuale/Pedal, 1935) in der Martin-Luther-Gedächtniskirche in Berlin-Mariendorf.